Em Ghost in the Shell: SAC_2045, somos transportados para o ano de 2045, após o mundo ter passado por um desastre econômico que colocou fim ao valor do dinheiro como nossa sociedade o conhecia. Por conta disso, as quatro principais nações do mundo começaram a investir em uma "guerra sustentável" para fazer com que a economia voltasse a girar. Nesta realidade, acompanhamos Motoko, Batou e outros antigos membros da Seção 9 que agora trabalham como capangas para o grupo GHOST. Eles usam suas especialidades em tecnologia e batalha para conseguirem sobreviver enquanto desarmam pontos importantes ao redor do mundo. No entanto, quando uma emergência "pós-humana" aparece e uma conspiração é descoberta, esses habilidosos mercenários precisam se reunir uma vez mais.
T1 · EP 1
SEM CONFLITO, SEM VIDA - Guerra sustentável
T1 · EP 2
POR SUA CONTA E RISCO - Divididos por um muro
T1 · EP 3
REBELDE - Desaparecido em ação
T1 · EP 4
SACRIFÍCIO DE PEÕES - Emissários da Divisão
T1 · EP 5
PATRICK HUGE - Presente de Deus
T1 · EP 6
REVELAÇÃO - Evangelho quantizado
T1 · EP 7
COMIDA PARA VER - Assalto a banco
T1 · EP 8
REUNIÃO - Consequência da morte de Togusa
T1 · EP 9
IDENTIDADE ROUBADA - Luta solitária
T1 · EP 10
PESSOAS VIRTUAIS - Causas da morte por sobrecarga
T1 · EP 11
ADOLESCENTES QUE SE ACHAM - Revolucionários de 14 anos
T1 · EP 12
NOSTALGIA - Todos serão N